到达南京之后的第二天，毛渊明便安排庄寒天和陈枫陪亚派耶脱四处游玩，自己和许纬辰等人开会商讨下一步的计划。
这一趟暹罗之行可谓成功之至，事前想要达到的目的都已经到达，只要等到亚派耶脱觐见皇帝谢恩之后，由皇帝下旨正式批准三国条约，进军南洋最重要的基础就被夯实了。至于五位法国传教士，许纬辰请罗文炤主教安排他们在教堂侍奉，并且抓紧学习汉语，等学习有成之后，就能为朝廷效力了。
许纬辰又为毛渊明介绍了这半年里的变化。根据京城军机处传来的战报，明军由野战军、朝鲜营和满洲兵组成的混成部队近五千人已经在九月之前到达雅克萨城，并且扎营驻防。由于到达的时间有些偏晚，再加上罗刹人早有准备，攻城的战斗极其不顺利，英制重炮的炮弹数量有限，无法摧毁罗刹军的棱堡，而罗刹军利用棱堡居高临下的优势，使用火炮和火枪射击，令明军难以进展。
不过，项绍宽已经严令，全力向雅克萨前线运送粮食、柴炭和棉衣，支持明军就地过冬。相比罗刹军，明军最大的优势就是补给线路相对较短，不怕打持久战，许纬辰之前招募的两千多船工也已经在辽河、松花江沿线布置完毕，运输能力大大加强。另外据报，布尔尼率军北进，已经抵达尼布楚城附近，但尼布楚罗刹军虚实如何，两军有无交战，胜负如何都还没有消息。整体上说，战事肯定不会在明年春天黑龙江解冻之前结束，但这样也好，如果轻易取胜，那么很可能像历史上康熙的雅克萨征伐那样，要打第二次才能彻底胜利。
陆希星则报告了在金厦稽查贪腐的情况。从结果看，金厦自贸区的腐败速度比想象得还要快。官员们主要通过少计货物、低估价值来获得洋商的金钱回馈，部分洋商还通过贿赂海军来规避对走私的核查。虽然走私的洋货上岸之后，仍有可能被陆上的税关查获，但福建全省上下都和郑氏集团的官员有千丝万缕的关系，江胜只要打一声招呼，往往小罚一笔钱了事。估计下来，过去三年金厦海关每年流失的税金都在十万两以上。
对于如何处置这次查获的海关官员，众人也是颇为挠头。若是严加处置杀一儆百，倒也不是不行，但效果恐怕未见得好，没有被查获的海关官员就未必干净，他们要是消极怠工起来，反而不利。好在大家有个共识，就是福建因为郑氏集团的缘故，其实很难治理，哪怕现在是姚启圣这样的狠角色在当巡抚，也无法解决好勋贵家族的问题。郑氏集团的勋贵们绝大多数都是福建人，现下还有大批亲族乡党住在原籍地，这些人仗着郑氏的军功，在当地抗拒朝廷诏令，欺压周遭百姓。哪怕是最好说话的陈永华，他家乡漳州府龙溪县登记土地户口，当地官员就报告陈氏家族拒绝官员实地勘察，只是交了一份自己写的“自查报告”。用这件事问陈永华，陈永华则含糊其辞，又说陈氏家风醇正，断无欺诓朝廷之理，又说自己年少时父亲陈鼎被清军所杀，全赖家族照顾才有今日。总而言之，不可细究。
不过，这一次之所以会让陆希星和苏沐汀去金厦查看，除了手头掌握了一些金厦海关贪腐的证据之外，最主要是因为姚启圣上奏参弹江胜纵容海军士兵勒索过往商船——同一件事，不同的人看来是不一样的，站在南京军机处的视角，是江胜收了商人的钱徇私枉法，但站在姚启圣的角度，但凡捉到走私商人，那商人必会说是被江胜的手下勒索，以逃避责任。
但不管怎样，可以趁此机会整顿一下福建海军。大明海军浙江、福建、南洋三支舰队，全都是由郑氏水师改编，虽然掺入了一些原耿精忠、尚之信的水师，也新招了一些水兵，但士兵都来自福建、广东沿海，很容易形成乡党，和项绍宽建设近代化海军的目的相去甚远。所以，蒋一正主张，让江胜回南京述职，顺便问一问走私的事情。
然而，情况的变化却令人始料不及。就在冬至当天，一份八百里加急的军报送到了南京军机处。蒋一正拆开一看，吃惊不小，连忙召集众人商议。原来是毛渊明离开柴棍之后，杨彦迪手下部将黄进发动兵变，杀死了杨彦迪和陈上川，陈上川的副将陈安平逃往河仙。陈大定因为率众为毛渊明送行，因此躲过一劫，现在也暂时在河仙落脚。
军报是陈安平发来的，对于黄进因何突然发动兵变没有解释。毛渊明和庄寒天等人苦思冥想，也想不出黄进为何要铤而走险，众人在柴棍之时，似乎并未察觉到陈上川军队的内部有什么显见矛盾。
不过既然事已至此，总要谋划对策。许纬辰认为，此事虽然性质恶劣，但发生在千里之外，不必反应太大，以免引发不必要的恐慌，尤其不能让亚派耶脱王储知道。可以由庄寒天和陈枫陪同亚派耶脱王储即刻启程，北上京城觐见皇帝，并且住到二月份皇帝寿诞之后。至于京城军机处那里，不发正式的行文，只要庄寒天私下和项绍宽他们报告一下柴棍的局势就行了。
至于应对叛乱的事情，也不必太过忧虑。虽然不知道黄进方面的具体情况，但军报中说，陈安平和陈大定各自都还有数百兵力在手。从原本驻柴棍的总兵力算来，黄进最多能剩下一千五百左右的兵力
、二三十条战船而已。本来打算招江胜到南京述职，现在正好改变计划，让江胜率领福建海军三十艘主力战舰出海，移往珠海港，会合朱天贵的南洋海军之后，一起前往柴棍征讨黄进。
而江胜离开福建之后，就可以再派大臣前往福建整顿海军，并且顺手处理一下金厦海关的事情。人选方面，郑智是不二之选，这位国姓爷的五公子出马，福建海军剩余的那些郑氏旧部肯定不敢造次，另外再派上苏努担任副手，应该可以完成使命。
毛渊明也提出，为了确保战争顺利，自己和蒋一正、吴千帆三人要前往督战。许纬辰和陆希星都默不作声，显然是不太放心毛渊明在前线的安危，但又无法反对——如果穿越者们不亲临前线，战场决策不能及时进行，对战争显然是不利的。
商议已定，立刻付诸实施。毛渊明等三人仍由孔国元保驾护航，坐船南下。到达珠海港之时，已是腊月二十三。朱天贵的南洋海军早已接到军机处的命令，开始准备南下，江胜的福建海军还在驶来的路上。
洪磊于是邀请毛渊明到广州城内小住，等过完年江胜的海军到达之后再出发。毛渊明对下南洋的宏大计划时时刻刻记挂于心，所以对黄进叛乱多少有些感到心烦意乱，也无心观赏广州百姓的花灯舞狮民俗。在广州过年期间，又收到了军机处的急报，说鄚玖发动了一次对黄进的进攻，被黄进打退。吴千帆觉得，很明显鄚玖是趁着这次叛乱，以平叛的名义攻打柴棍，试图扩大自己的实力，鄚玖这个人的野心不小，今后也要加以提防。