布纽虽然样貌木讷、言行让人发笑，心思却异常狡猾。布纽在识破了凤源的真身后，想埋伏凤源但却反被识破，还被凤源暴打了一顿，最后躲进焚化炉里才逃过一劫。随后，布纽劫持了凤源的房东·美山咲子作为人质，用宇宙绳索抓住了凤源并将其带到了布莱克指挥官的面前。因为宇宙绳索的缘故，即便凤源变身为雷欧奥特曼也无法挣脱，更不能巨大化。布纽和布莱克指挥官趁机发难，以超低温折磨雷欧奥特曼，最后将雷欧奥特曼切碎后抛尸山林。
雷欧奥特曼已死，布纽巨大化现出真身，对地球进行大肆破坏。但不久，雷欧奥特曼·奥特曼就被奥特之王的「再生光线」复活，现身和布纽交战。布纽虽然依靠多种远程技能让雷欧奥特曼一时受挫，但奈何自身战斗力太弱，不久就被雷欧奥特曼的反击打成了重伤。最终，布纽被「雷欧奥特曼飞踢」的攻击踢断了首级，身体化为一滩黏液后彻底消灭。
布莱克恩多，布莱克星派出的最强圆盘生物，为了对雷欧奥特曼奥特曼发起最后的挑战，入侵地球后引发地震，为引雷欧奥特曼奥特曼出来而呼叫其名，由于暂时的没有发现雷欧奥特曼奥特曼，因此撤退了。
之后，布莱克指挥官在确定了凤源的所在之地后，在布莱克指挥官的呼唤之下再度现身和雷欧奥特曼奥特曼对决。布莱克恩多最初使用了尖角的力量与喷火的能力和尾巴的攻击一度将雷欧奥特曼奥特曼给压制住了，雷欧奥特曼奥特曼很费力地摆脱了束缚。
在火焰的攻击落空了之后，布莱克恩多遭到了雷欧奥特曼奥特曼的反击，角被雷欧奥特曼奥特曼给折断了并反捅入了自己的口中而处于下风。布莱克指挥官见状，趁机劫持了通为人质，使雷欧奥特曼奥特曼分了神，战局瞬间被扭转了，雷欧奥特曼奥特曼被布莱克恩多连续甩尾猛击到了红灯闪烁的状态，意识涣散而晕倒在地上。
危急时刻，通的好友们趁布莱克指挥官得意之际，突然一拥而上夺走了布莱克指挥官召唤圆盘生物的水晶球，通把布莱克指挥官的水晶球掷向了雷欧奥特曼奥特曼，倒在地上的雷欧奥特曼奥特曼强打起精神站了起来。布莱克恩多猛烈地撞向了雷欧奥特曼奥特曼但被雷欧奥特曼奥特曼给躲了过去，最终被雷欧奥特曼奥特曼用获得了的水晶球投掷爆炸而死。
水晶球不仅可以命令圆盘生物们，也是联系布莱克指挥官的生命，水晶球被毁了之后，布莱克指挥官便随着最强最后圆盘生物布莱克恩多的死，而一同化作泡沫死去了，布莱克星也被雷欧奥特曼奥特曼彻底消灭。
仅仅复活圆盘生物，是还不足以造成很大作用的，普莱舍星人为了复仇，在怪兽墓场里还找寻到了其他的，昔日曾经听闻过的怪兽宇宙人们。
阿库玛尼亚星人，栖息在陨石中的宇宙恶灵，以巨大眼珠的陨石姿态向地球飞来后，躲避mac队的追踪，在7238地点上空消失，变为无数的恶灵潜伏并占领少年隆所居住的小区中，到处都会引起“辐射现象”，对感受到住宅区异常而前来调查的凤源和诸星团队长传达了离开这里的指令，但是因为凤源妨碍了恶灵的行动，所以再次变为陨石，用从胸口巨大眼睛发射的火箭弹攻击住宅区。在与雷欧奥特曼的对决中长出四肢后现出真面目，双手即使被雷欧奥特曼扯断也照样能用念力控制它们进攻雷欧奥特曼，雷欧奥特曼一度被阿库马尼亚星人的招式击倒。后来在赶来支援的阿斯特拉帮助下，雷欧奥特曼兄弟施展「奥特双重闪光」将阿库马尼亚星人变回陨石，由阿斯特拉遣送回宇宙彼方。
贝铭星人，来自宇宙中拥有最多植物种类的星球——贝铭星，操纵着贝铭星原产毒花的宇宙人，慌称“让疲劳的孩子们享受睡眠”，真正目的是侵略地球，最初化身为被称作「开花老头」老人的姿态在街上徘徊，获得孩子们的人气，散布银色星屑在城市中然后大量的开出恶魔之花，散发的花香让孩子们接二连三的患上嗜睡症。但是，被梅田通偷拿出来的一部分银色星屑状物体被mac查知不是地球上存在的物质，mac队为了确保安全，发布警戒命令，限制了附近小孩们的外出，并全力搜寻敌人。
之后，贝铭星人化身的老人在空无一人的街道上遇到了梅田香打算继续发放恶魔之花，在「白花精灵」的提醒下被梅田香识破了其真面目，凤源赶来救下了梅田香并揭穿了贝铭星人的阴谋，贝铭星人随之巨大化开始破坏城市，用手中喷出的藤蔓气体配合破坏光线将mac的战斗机击落。凤源变身成雷欧奥特曼·奥特曼与贝铭星人展开了战斗，贝铭星人凭借自身多彩的能力使雷欧奥特曼苦战，后两手被挣脱束缚的雷欧奥特曼用「奥特披风」封堵，连续受到雷欧奥特曼的手刀与踢击并被投飞，最终被雷欧奥特曼使出的「计时器射线」击中头部，身体发生大爆炸而七零八落。
超能力星人乌林加，宇宙人遗弃到地球上的小孩，平时化为一个普通小孩的模样，性格暴躁，十分任性，因为身体被强制缩小的憋屈而积蓄了压力，在民宅区附近的神社内遇到了玩挤馒头游戏的梅田通一行人，加入游戏的乌林加忍受不了挤压而用念力挣脱，之后又用念力将梅田通等人推倒后逃走。由于乌林加引发的异常事件被mac队查知，诸星团与凤源出击赶往现场，诸星团在从梅田通口中得知乌林加变为的少年乌利是外星人后便开始追踪乌林加，不过追击途中团被与安奴相似的女性吸引而使乌林加逃离。
之后，乌林加再度出现，在游乐园中反复恶作剧，破坏了游乐园内的设施。看不下去的诸星团施展「奥特念力」与乌林加展开展一场势均力敌的念力对决，在凤源的枪击下，乌林加变化为原本的巨大化姿态开始暴走，凤源变身雷欧奥特曼·奥特曼登场与乌林加展开对战，由于乌林加的反重力光线，雷欧奥特曼陷入了连续的苦战，雷欧奥特曼在战斗中注意到了乌林加使用念力前需要集中精力的时间间隙，雷欧奥特曼利用这个间隙使乌林加被抛物面反射天线反弹了念力而弱体化，最后被「奥特披风」覆盖恢复到了乌利的样子，与和安奴相似的女性被雷欧奥特曼一同送回宇宙。