罗辑的一举一动被智子一点不拉的传递到了三体最高执政官那里，三体执政官看到了罗辑的自我破壁行为，因此三体执政官那开始学会隐瞒的思维也知道了罗辑参悟了宇宙的真理，所以其再次命令智子给ETO下令，消灭罗辑。
三体执政官想让罗辑带着黑暗森林法则，永远沉睡不再苏醒。
……
互联网中的虚拟三体世界。
有两颗流星在缓缓地穿过星海，大地上的一切都处于黑暗中，远方的地平线在漆黑中与夜空融为一体。黑暗中有一阵私语声，看不到说话的人，这语声仿佛本身就是黑暗中飘浮的无形生物。
锵的一声轻响，一个小火苗在黑暗中出现，四个人的面孔在微弱的火光中时隐时现，他们是秦始皇、亚里士多德、冯·诺伊曼和孔子，火光来自亚里士多德手中的打火机，几支火把伸了过来，亚里士多德点燃了其中的一支，然后几支互相点燃，在荒原上形成一片摇晃不定的光亮，照亮了一群各个时代的人，他们之间的私语仍在继续着。
秦始皇跳上一块岩石，举起长剑，众人立刻安静下来。
“主发布了新指令：消灭面壁者罗辑。”秦始皇说。
“我们也接到了这个指令，这是主对罗辑发出的第二道诛杀令了。”墨子说。
“可现在杀他不容易啊。”有人说。
“不是不容易，是根本不可能。”
“如果不是伊文斯在主的第一道诛杀令中附加了条件，五年前他就死定了。”
“也许伊文斯有道理，我们毕竟不知道真相。罗辑也真命大，在国际联合大会广场又让他逃过一次。”
……
秦始皇挥剑制止了议论，“还是讨论一下怎么办吧。”
“没办法，谁能接近那个两百米深的地堡？更别说进去了！那里防守太严了。”
“考虑过用核武器吗？”
“见鬼！那地方就是上世纪冷战时的防核掩体。”
“唯一可行的办法，是派人渗透到警卫部队内部。”
“这可能吗？这么多年了，有谁成功渗透过？”
“渗透到他的厨房！”这话引起了几声轻笑。
“别扯淡了，主应该告诉我们真相，也许能想出别的办法。”
秦始皇回答了最后那人的话：“我也提出过这个要求，但主说这个真相是宇宙中最重要的秘密，绝对不能透露，当时同伊文斯谈起，是因为主以为人类已经知道了真相。”
“那就请主传递技术！”突然孔子开口到。
孔子的话得到了很多附和，秦始皇说：“这个要求我也提了，出乎预料，主一反常态，没有完全拒绝。
人群中出现了一阵兴奋的骚动，但秦始皇接下来的话平息了兴奋：“但主在得知目标的位置后，很快又拒绝了这个要求，它说就目标所处的位置而言，能够向我们传递的技术也无能为力。”
“他真有这么重要吗？”冯·诺伊曼问，他的语气中带着掩饰不住的妒忌，作为第一个成功的破壁人，他在组织中的地位迅速提高。
“主很怕他。”秦始皇说。
爱因斯坦说：“我考虑了很久，认为主对罗辑的恐惧只有一个可能的原因：他是某种力量的代言人。”秦始皇制止了在这个话题上的进一步讨论：“别说这些了，还是想想怎么完成主的指令吧。”
“没办法。”
“真的没办法，一个无法完成的使命。”
秦始皇用长剑铛地敲了一下脚下的岩石，“这个使命很重要，主可能真的遇到了威胁，况且，如果能够完成，组织在主眼中的地位就会大大提高！这里聚集了世界上各个领域里的精英，怎么会想不出办法？大家回去好好考虑一下，把方案通过别的渠道汇集到我这里，这事要抓紧做！”
火把相继燃尽，黑暗又吞噬了一切，但窃窃私语仍在继续。
……
最终三体人根据暗杀罗辑的需要，通过智子给了ETO组织一个很有用的武器，即人类众多生物学家以及阴谋家想要的基因武器——基因导弹。
ETO在获得三体人的技术支撑之后，很快制造出了专门针对罗辑一人的基因武器，这款武器以流感的形式向罗辑所处的地下安全屋内的人员扩散。
在罗辑参加面壁听证会之前，罗辑就发现了他的联系人坎特身体不太好的现象，并且罗辑也询问了坎特。
“你听起来好像感冒了？”罗辑问。
“只是染上了轻流感。”坎特回答。
“禽流感?！”罗辑吃了一惊。
“不是，是轻重的轻，媒体上都这么叫。是一个星期前在附近城市流行的，感染率很高，但症状很轻，不发烧，就是流鼻涕，部分患者可能嗓子疼。不用吃药，三天左右就自动痊愈了。”
“流感一般都很重的啊。
“这次不是。这里的很多士兵和工作人员都传染上了，你没发现房间里的勤杂工换人了吗？她也得了轻流感，怕传染上你，但我这个联络员一时还换不了。”
……
坎特为了罗辑的身体健康而换了罗辑身边的安保勤务人员，但他没想到因为他，罗辑反而感染了基因导弹。
在听证会结束后，在准备进入冬眠的期间，罗辑患上了轻流感。最初的症状与别人一样，只是流鼻涕和嗓子轻微发炎，他自己和别人都没在意。但两天后，罗辑的病情加重了，开始发烧，罗辑的医生感觉有些异常，就取了血样回市里分析。
这天夜里，罗辑在高烧中昏睡，一直被狂躁的梦境所缠绕。梦中，夜空中的群星在纷乱地舞动着，像振动着的鼓皮上的沙粒，他甚至意识到了这些星球间的引力联系，它们做的不是三体运动，而是银河系中所有恒星的2000亿体运动！后来，纷乱的星海渐渐聚成一个巨大的旋涡，在疯狂的旋转中，大旋涡又幻化成一条由所有星星凝成的银色的大蛇，呼啸着钻进他的大脑…
凌晨四点左右，张翔被电话铃惊醒，是行星防御安全部的领导打来的，声音严厉，让他立刻报告罗辑的病情，并命令基地处于紧急状态，一个专家组正在赶来。
张翔刚放下电话，铃声又响了，是地下十层的医生打来的，报告病人的病情急剧恶化，现在已处于休克状态。张翔立刻乘电梯下去，惊慌的护士和医生告诉他，半夜里罗辑先是呕吐，接着开始吐血，然后就昏迷不醒了。张翔看到病床上的罗辑脸色煞白，嘴唇发紫，在他身上几乎看不到生命的迹象了。
专家组很快赶到，有国家紧急疫情处理中心的专家、华夏军方总医院的医生和军事医学科学院的一个研究小组的全部成员。
在其他人察看病情时，军事医学科学院的一位专家把张翔和坎特拉到门外，向他们交代了情况。
“我们早就在注意这场流感，感觉其来源和性状都很异常，现在明确了，这是基因武器，或者叫基因导弹。”
“基因导弹？”
“就是一种经过基因改造的病毒，传染性很强，但对一般人而言，它只是产生轻流感这样的轻微症状，但这种病毒具有基因识别能力，能够识别某个人的基因特征，一旦这个攻击目标被感染，病毒就会在他的血液中制造致命的毒素，现在我们知道目标是谁了。”
张翔和坎特面面相觑，先是难以置信，然后陷入绝望，张翔脸色变得苍白，缓缓低下头说：“我负完全责任。”
这位大校研究员说：“张主任，也不能这样说，这真是防不胜防，我们开始虽然怀疑，也没有向这方面考虑。基因武器的概念上世纪就出现了，但谁能相信竟然真有人把它造出来了。
虽然还很不完善，不过作为暗杀武器真的很可怕：只需要在目标所在的大致范围撒播这种病毒就行了，甚至连目标的大致范围也不需要知道，可以在全球撒布，因为这种病毒对一般人致病性很弱甚至没有，可以快速大范围传播，最后也有很大的可能击中目标。”
“不，我负全部责任。”张翔用一只手捂住眼睛，“要是史队长在的话，这事就不会发生。”他放下手，眼中闪着泪光，“他冬眠前最后对我说的一句话，就是你刚才说的防不胜防，他说小张啊，我们这工作，睡觉时都要睁半只眼，现在没什么万无一失，有些事防不胜防啊。”
“那下一步怎么办呢？”坎特问。
“病毒已经侵彻很深，病人肝脏和心肺功能都已衰竭，现代医疗手段无能为力了，尽快冬眠吧。”
由于蓝星当下医疗生物技术不足以治疗罗辑所患的基因导弹，所以PDC直接将罗辑进行了冬眠，期望当罗辑苏醒后，那时的技术能够治疗这款针对罗辑的基因导弹。
罗辑是在梦里进入的冬眠状态，从这方面看此时的罗辑还是很幸福的……