不是可能存在,而是一定存在。
因为制备样本中的rRNA占到了总RNA的80%以上。
这样在测序时,准确性必然会受到无可估计的影响。
“梅林,你的担心是正确的。”陆时羡给予他认可的眼神道:“因此我们必须通过RNA富集的方法去除rRNA的干扰。”
说到这里,就算几人再迟钝脑中也迅速想起一个字眼。 𝓜.🆅🄾𝓓🆃𝙬.𝕃𝔸
“oligo-dT富集法?”
“没错。”陆时羡打了个响指:“虽然剔除rRNA后进行WTA也有人使用,但在学界里,由于样本质量的高效性,一般都适用oligo-dT对poly(A)RNA进行富集。”
“rRNA剔除法较之于oligo-dT富集的缺陷是要求更高的测序深度,不然样本的rRNA依然会存在一定的数量,富集效果并没有达到想要的程度。”
这话说的已经非常直白了,以至于后面的操作流程都无需继续强调了。
不过陆时羡还是非常认真地继续着接下来地进行操作。
然后,才终于来到了最后的测序环节......
这就是会议上曼伦教授要求陆时羡小组所做的全部工作。
看似只有两个字,但需要完成的工作实则非常繁琐和细致。
三人接下来停止了手里的工作,围站在陆时羡周围看着他操作。
俗话说外行人看热闹,内行人看门道。
别人可能看的一头雾水,但他们还不至于连操作的内容都看不懂。
对RNA进行片段化及纯化操作。
对片段化RNA的产量及片段大小分布进行分析。
对cDNA进行反转录、纯化以及扩增,选择适宜的片段大小建立扩增文库。
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第453章 都是基本操作,大家先坐下(2/2)
整个操作还显得平缓,虽然在过程中慢慢变的流畅,但还在他们的可接受范围之内。
可现在,陆时羡的操作简直像是侵淫这项技术十数年的老手。
不过这个技术都才刚出来,他们自然将这个可能性视为天方夜谭。
那么就只能归功于陆时羡非同一般的实验操作天赋了。
不过,这一点确实如此。
上一世,陆时羡能够成为老板的头号打工人,相反并不是因为他的学术天赋和直觉有多好。
而是因为他从本科就开始崭露头角的实验操作技术。 🄼.𝓥𝙤𝙙𝙏𝙬.𝙡𝓐
正是凭借着这个东西,他才能混迹在学校的各种项目中,攒够保研所需的第一桶金。
但操作这个东西受制于平台大小的程度更甚于理论研究。
混的时间再久,他所得到的大多只是国内的期刊成果。
就算偶有SCI,也只是无关紧要的署名而已。
所以工具再趁手,它也只是一件工具而已。
然后,自从重生后。
他已经在历次的实验中,感受到自己的实验操作似乎在上一世的基础上又有所精进。
老练的经验加上充沛的精力造就了这一点。
这也是陆时羡如此有信心完成测序工作的理由之一。
不过,无论是现在还是遥远地将来,他从不满足于成为所谓的工具。
......
在日渐默契地合作中、加班加点地爆肝中以及他超快的测序效率中,陆时羡在第七天,也就是第一个星期结束前完成了所有测序工作。
测序自然不可能结
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